Para el estudio de las enfermedades neurodegenerativas es esencial emplear modelos murinos in vivo donde poder analizar la interacción entre los diferentes tipos celulares presentes en el sistema nervioso central (neuronas, astrocitos, microglia, etc). Los ratones transgénicos son una herramienta poderosa aunque existen fenómenos de compensación durante el desarrollo. Por ello es importante conocer otros posibles modelos murinos basados en la administración sistémica o estereotáxica de toxinas. En los últimos años también se han desarrollado modelos basados en la inyección estereotáxica de virus adeno-asociados para sobre-expresar de forma selectiva determinadas proteínas o fibrillas pre-formadas que asemejan en gran medida el curso de las enfermedades neurodegenerativas como el Parkinson.